学院现有两个硕士学位授权点、五个职能科室、三个研究中心、一个教育中心、四个教研室、一个实验室。

两个硕士学位授权点：法律硕士专业学位授权点、临床医学（医事法学）二级学科硕士点

五个职能科室：党政办公室、教务科、学科办、学生科、《医学与法学》编辑部

三个研究中心：四川医事卫生法治研究中心、地方立法研究中心、医事法学协同创新中心

一个教育中心：法律硕士教育中心

四个教研室：法学理论教研室、实体法学教研室、程序法学教研室、医事法学教研室

一个实验室：模拟法庭实验室